Зачем нужна двухфакторка на сайте налоговой, это чтобы кто-то случайно за меня деклу не заполнил? или есть еще какой-то глубокий смысл, вроде охранять особо нечего. Просто под это аж отдельная статья на телеграфе.

Потому что система построена так, что никакие действия в ЛК налоговой - заявки, зачеты, подача деклараций, уплата налогов и т. д. без двухфакторки нельзя сделать и да, это защита налоговой информации пользователя, что логично.