Мы хотим полететь по маршруту Пхукет- Сингапур (48 часов) Сингапур - Куала-Лумпур (транзит) - Пхукет, такой перелет возможен? Так как летим через Куала-Лумпур? Или все равно Пхукет конечная точка и так не пропустят?

Пропустят. должно быть три страны и транзит в СГ. например Пхукет-КЛ-Сингапур-Пхукет или Пхукет-Сингапур-КЛ-Пхукет.

У нас такой же маршрут, по идее должны пропустит. Соблюдается правило 3-й страны, а куда лететь после 3-й страны - это уже личное дело каждого)

Мне кажется транзитом не должно быть. При въезде в Сингапур нас просили показать билет в 3 страну , спросили сколько дней, бронь на отель. Как я понимаю страна вылета должна отличаться от страны откуда летели в Сингапур.