Как добраться дочери до Магдебурга из РФ на обучение? Я так понимаю через Польшу на автобусе не вариант?

Перелет через Армению, это дешевле, чем через Турцию (обычно). Если наземные пути, то через Литву вроде с визой Д можно проехать, из Калининграда (никогда не ездила, но тут часто бывает описание этих маршрутов)

Откуда дочь поедет?

Попробуйте из Москвы в Спб. Там автобусом до Таллина. Из Таллина в Берлин самолет. А Магдебург там уж рядом. RYANAIR выходит очень бюджетно обычно. Это если виза D.