Кто легализовался в Черногории, подскажите пожалуйста: у меня боравак на паспорт 1, недавно получил в Боснии паспорт 2

Могут. Может вы его в чг получали. Это не проблема. Нужно в мупе пойти сказать что у вас новый паспорт. Когда первый самый боравак делают. Тогда важно по какому паспорту въехал на него и оформление.