Пдскажите пожалуйста, какой Smart Card reader лучше использовать, для электронной подписи ?

Скорее всего любой, так как реально он нужен один раз чтобы привязать свою подпись к eparakst, а дальше уже подписывать все приложением.

Я в магазине первый попавшийся купил. Не так часто он используется, какая разница, что будет на полке лежать.