Пропустят ли двух граждан РФ на машине с росс. номерами и открытой шенгенской визой доехать до аэропорта Вантаа, чтобы улететь в Стамбул и далее в Болгарию?

Да.

В нешенген транзит через Фи по-прежнему возможен. Вам нужно будет билеты в Стамбул показать.

Стамбул и Болгария не Шенген, так что, с незамедлительным вылетом, все ок.