Вылетела из Бали в Сингапур и на таможне требовали билет в третью страну ( правила для русских/украинцев и белорусов) мы показали билет в Малайзию.

Если правила транзита говорят лететь в третью страну значит вы должны взять и полететь в третью страны, иначе вы нарушаете законы страны. Благодаря таким кейсам Сингапур может сделать так что не будет никакого транзита в третью страну без визы, так что пожалуйста делайте по правилам страны.

Да, лететь в третью обязательно, так как иначе вы на территории Сингапура непонятно на каких основаниях находитесь