Можете пояснить, в Португалии с учетом того что разница между подачей заявления в консульство и получением визы примерно полгода

В момент оформления записи в консульство на визу D иметь на руках справку о несудимости и годные по срокам свидетельства о браке - не нужно. Вы их приносите уже непосредственно на подачу документов. Это первый раз, когда вам их нужно будет получить. Второй раз - на подачу в СЕФ.