Я правильно понимаю, что если открыть ИП в Португалии, то со второго года надо платить социалку 21,4%, и налоги 20-27%, и потом ещё ндс в некоторых случаях?

НДС не платится, если его платит компания в ЕС, с которой вы сотрудничаете. Плюс может быть снижение налогооблагаемой базы в 1-2 года. Около 30% будет потом.