У нас следующая ситуация- я 3е поколение(дед еврей), у жены 2е детей от предыдущего брака. Для того что бы мы могли семьей репатриироваться должен ли я их официально усыновить?

Нет. Достаточно быть в официальном браке с их матерью и получить нотариальное апостилированное согласие от их отца на въезд, проживание, получение гражданства и оформление всяческих документов.