Знает ли кто-то примеры реальных последствий при проверке документов в Шенегене за пределами Португалии для тех, кто уже подался на ВНЖ в SEF, но ещё его не получил?

А в чем нарушение? вы границу с Шенгеном пересекали законным путем? Если да, то вы внутри шенгенской зоны и находитесь там легально. Другой вопрос, например, если вы въехали по туристической визе и уже просрочили свое пребывание или сама виза кончилась, но там начинают действовать другие правила. К примеру, у СЭФ есть три месяца на то, чтобы задать вам какой-либо вопрос по вашему кейсу (не уверен про три, нудно вспоминать). Если вопрос не задан, то автоматически по закону португалии вы становитесь резидентом страны и вправе стребовать свою резиденцию (и есть конкретные кейсы, когда это получалось). Другой вопрос, что не всегда есть силы и желание это объснять в другой стране и тут каждый сам выбирает ехать и рисковать или нет.

@kirill: Вы в шенгене можете находиться не более 90/180, все что свыше нарушение. Кроме Португалии, вас депортируют с записью в сис, что уже было неоднократно.

@Oлег: Пока вы находитесь по туристической визе. Как только Португалия, как член ЕС и Шенгенского соглашения приняла ваши документы, чем подтвердила смену статуса вашего нахождения.

@Oлег: Я въезжал по визе D, не по туристической.