Подскажите, можно ли лететь компанией Fly Arna по российскому паспорту?

В Ереван точно можно.

Это не зависит от авиакомпании. в Армению в принципе можно по внутреннему паспорту.

Да, я поехала и приехала внутренним паспортом.

Да. Я оформлял билет на гражданский паспорт, по нему регистрировался и проходил контроль с двух сторон. Проблем ноль.