Если тур шенген не открыт, можно ли по нему поехать в другую страну не усложнит ли это дальнейшей подачи?

Можно, но могут спросить на въезде почему вы так едете (показать дальнейший путь до страны, выдавшей визу), но я предпочитаю так не делать, но выбор каждого.