Первый раз думаю полететь с пересадкой. Если рейс из рф в Стамбул, а потом из Стамбула в газипашу. Надо регистрацию на два рейса сделать на стойке в РФ или в Стамбуле по прибытию?

В РФ на стойке регистрации вам сделают регистрацию только на рейс из РФ до Стамбула. В Стамбуле уже дальше до Газипаша ( если нельзя сделать это онлайн) то снова проходить регистрацию вам. Багаж же должен лететь от РФ до Газипаша напрямую ( но уточняйте всегда по багажу именно в РФ)

Зависит от Вашего билета. Если билет единый , Вы летите одной АК, на регистрации в РФ получаете два посадочных, по прилету идёте в транзитную зону, не промахнитесь, там свой паспортный контроль и досмотр. Выходите в зал ожидания, ждёте посадку. Багаж не получаете, он сразу летит в Газипашу. У Туркишей так, но уточните на стойке. Это если совпадает аэропорт прилёта и вылета в Стамбуле, проверьте на всякий случай. Если у Вас два отдельных билета на полёт, то по прилету идёте в общий паспортный контроль, получаете багаж и идёте регистрироваться на следущий рейс. Также смотрите, совпадают ли аэропорты прилета и вылета.