Можно ли проехать Литву транзитом из Петербурга до Вильнюса на поезде? Потом в аэропорт и самолётом до Мюнхена. Виза немецкая по приглашению дочери. У дочери ВНЖ. Я - гражданка России.

Нет.

Вряд ли.

В Вильнюсе никого не выпускают уже давно, забудьте.

Можно проехать через Кибартай жд или пешим попробовать, но если у вас билеты и время поджимает, то Прибалтику и Польшу рассматривать не стоит на въезд.