Подскажите, статус нерезидента в Португалии является уведомительным, а не автоматическим, то есть нужно как-то налоговой об этом сообщить?

Да. Но четкого процесса уведомления мне, например, неизвестно.

Думаю это уже рассчитано на сознательность граждан, уехал из России открыл счет в течении 180 дней, уведоми. Например если открываете в Турции счет условно в Дениз банке, там точно есть обмен данными( так говорит интернет), а при получении внж должны уведомить в любом случае, хоть 180 дней прошло, хоть 360.