Сориентируйте, пожалуйста, куда бежать в такой ситуации: подала с дочкой на получение ИИН, дочери в тот же день все пришло

Вам уже нужно обратиться в ЦОН.

Может ли быть, что два последующие отказа из-за того, что первое заявление в работе? - точно нет.

А вообще если и отказ не приходит, то перспектива разобраться и получить всё нормально видится сомнительной, бывал на памяти такой случай, человеку пытались сделать раз 30-40, в итоге все заявки просто зависали где-то в МВД, ЦОН никаких пояснений по этому поводу дать не смог.