у меня друг в Казахстан въезжал по своему внутреннему паспорту, а в Грузию из Казахстана по загранпапорту. У него с этим не будет проблем, его пропустят?

Не будет в Грузию из Грузии он не может по др паспорту, кроме международного в Казахстане он по внутр в рамках договора стран, это не накладывает ничего на права летать в др страны по международке.

Просто при выезде из Казахстана показывает свой внутренний паспорт, при въезде в Грузию - загран.