Делаем регистрацию и у друга только паспорт РФ.

В паспортном столе сказали что всё ок и поставят в него, но насколько я знаю отметки в паспорте РФ не от органов РФ делают его недействительным. Кто-нибудь сталкивался с такой ситуацией и может подсказать будут ли проблемы с получением заграна по такому паспорту?