Мне выдали не Visitor visa, a Worker visa на три года. Чем она отличается от Visitor ? Как остаться в Канаде по истечению срока действия визы?

Так же как и обычно.

Ваш главный документ — work permit за это время у вас накопится достаточно опыта, чтобы податься на PR. Но смотрите условия провинциальных и федеральных программ.