Я планирую в ближайшие несколько месяцев переехать в Португалию по визе d1/d3 но уже в ближайшие пару недель окажусь там, имея только шенген и гражданство РФ.

Нужен только паспорт и подтверждение адреса в РФ. Для этого подойдет выписка из банка, там есть упоминание адреса. Если она только на русском, переведите, чтобы они видели адрес, тк он вносится в форму.

Да, сможете, самостоятельно. Для этого нужно в районе 7: 30-8: 00 подойти к налоговой недалеко от пл. Маркиза де Пумбала по адресу: R. Rodrigo da Fonseca 57,1250-190 Lisboa и в обязательном порядке отстоять очередь до открытия в 9: 00. Затем в течение 5-7 минут заканчиваются талончики электронной очереди среди тех, кто отстоял эту очередь, талончиков выдается до 60 штук. Вариант категорически не подходит любителям поспать, в этом случае лучше обратиться к помогайкам. Для оформления NIF потребуется загранпаспорт и свежая выписка из онлайн- банка на английском с указанием адреса в стране проживания. Люди несут такие выписки с адресами в Индии, Китае, странах Африки, весь мир. Россияне несут выписки из Тинька, Райффайзена, везде где справку с указанием вашего адреса легко выгрузить из приложения. С момента получения талончика до выдачи нифа проходит примерно час-полтора, т. е. придя в 7: 30 в 10: 30 ниф у вас будет на гарантии.