Если не успел сделать уведомление за 3 дня, можно ли как-то это сделать позже и будут ли какие-то проблемы?

если кто-то хочет сделать уведомление о пребывании, чтобы иметь возможность остаться в РК до 90 дней - не нужно ничего делать! Вы и так по закону можете столько находиться не выезжая, а уведомить миграционную это обязанность принимающей стороны и они несут административную ответственность за это. Не нужно договариваться чтобы вас зарегистрировали по всяким левым адресам! Я спрашивал у работника миграционной. Шах и мат товарищи бизнесмены и предоставители услуг!