Скажите, если приезжает брат с дочкой и у них есть все докты для репатриации, им подавать в мвд по городутили есть возможн прямо в бен гурионе подать?

В Бен Гурионе некуда подавать документы, и никогда такой возможности не было. Только, если бы у вас была виза после консульской проверки в России. Всё через МВД теперь.

Вопросами репатриации за рубежом занимаются консульства Израиля. В самом Израиле этими вопросами занимается МВД Израиля. Подавать документы следует в МВД по месту жительства.