Я немного не понял, надо делать апостили на документы уже переведенные или в рф можно сделать на нотариальные копии, а перевести и апостилировать еще раз уже в португалии?

Самый простой способ - сделать нотариальную копию документа и апостилировать копию в России, а далее уже в Португалии сделаете перевод апостилированной копии на португальский.