Через Москву сложнее репатриироваться, чем через Израиль? Больше требуют документов и т. д.?

Как и во всех израильских учреждениях, все зависит от конкретного человека, в данном случае — от консула. В Израиле консулы бывают разные, и требования у них — тоже разные. Но если консулу покажется, что вам непременно нужно принести и показать еще какую-нибудь бумажку, то добывать эту бумажку проще в стране исхода, чем в Израиле.

Сложно сказать: документы требуют те же, возможно, на апостили в Израиле сейчас смотрят не так пристально. Ожидание проверки в Москве сейчас дольше. Но скорость рассмотрения Вашего кейса зависит именно от Ваших документов и Вашей семьи.