Помимо рейса из Рима в Москву, который уже отменила, у меня были билеты из Москвы в Южную Африку через Амстердам компанией КЛМ.

Как КЛМ незнаю и боюсь ошибиться и сказать не верно, но вроде если один маршрутный лист то должны вернуть за все, а если разными покупали, то скорее всего нет. У меня был маршрутный лист ЕКБ-Москва-Милан и обратно, мне за все перелёты возврат, хоть и летают по России. Но это Аэрофлот мне так сказал.

Если это единый билет, при невозможности совершить вылет по первому сегменту, автоматически аннулируетсч 2- ой, у них обычно на сайте эио стоит, поищите.