Можно отправить документы в wes для эвалюации диплома в конверте ВУЗа не из России, а прям из Канады? Им же без разницы, откуда к ни документы приедут?

Можно — так будет гораздо быстрее и надёжнее. Главное — чтобы конверт был запечатан ВУЗом по всем правилам WES. ВУЗовский конверт для лучшей сохранности имеет смысл положить в плотный картонный конверт Canada Post или Xpresspost и не забыть написать номер файла и на ВУЗовском, и на картонном конверте.