Купила билеты Aegean Москва-Мадрид с пересадкой в Афинах. Могут возникнуть проблемы при регистрации?

Я так понимаю, что и пассажиров и багаж сразу должны регистрировать на конечный пункт, т. е. Испанию, а в туда вроде как нельзя... Из всей кейсов здесь видела только покупку разных билетов, Москва-Афины, Афины-Мадрид. Кто-то покупал билеты, как я?