Вписывается ли в сроки транзита то, что между автобусом и самолётом у мамы получается около 40 часов?( Всегда казалось, что на него дается 48 часов).

Это не транзит, если мама не живет в Германии, не говорите слово транзит.

Транзит - это для вас, потому что вы живёте в ЕС. Для вашей мамы это не транзит, а туризм в ЕС.