По возвращении в Россию из Египта, уже не нужно регистрироваться на госуслугах, если есть QR код? Или я чего-то не понимаю?

Не нужно. Но код вы должны получить, заполнив электронную анкету прибывающего в рф. Когда заполняете анкету прибывающего, то вылезает такое окно при наличии сертификата о вакцинации. Если нажимаете подтвердить, то вторую анкету о передаче пцр или сертификата заполнять не нужно.