Из Минска в Вильнюс на автобусе можно доехать гражданину России? Эколайнс продает билеты, и ехать ближе, чем до Риги.

Да.

Если рассмотреть Литву как транзит, то будет просто дороже. Непонятно почему, но из Вильнюса или Каунаса авиабилеты на порядок дороже, чем из Риги или Таллина.

Да.