Австрия разрешает въезд по неоткрытому шенгену, выданному консульством Испании? Лететь из РФ можно через Стамбул в Вену и соответственно обратно этим же маршрутом?

Доброе утро! Ну, вообще, это нарушение правила первого въезда. Вас могут не пустить или, если пустят, то будут проблемы с визами Шенгенским в дальнейшем ….

Про второй вопрос - да. Именно так сейчас и летаем. РФ-Стамбул-Вена и Вена-Стамбул-РФ + другой вариант это: РФ-Белград-Вена и Вена-Белград-РФ.