Скажите пожалуйста как пересечь границу России Эстонии, далее в Испанию у меня тур виза Испании, у сына моего испанское гражданство ему 8 лет? Нужно ли предоставлять основания для выезда?

Мое мнение, что это сопровождение несовершеннолетнего. Так что он выезжает к своему месту жительства, а Вы его сопровождаете. Не надо других бумаг.

Они у вас уже есть.

Позвоните в управление погранслужбы по СПб и Ленобласти ( на Шпалерной ) и опишите свою ситуацию ( на письма они не торопятся отвечать...). Если они скажут, что все ОК, на границе уверенно говорите, что начальство разрешило, пусть они уточняют...(Все звонки фиксируются, но обычно достаточно упоминания о звонке...)