Подскажите пожалуйста, при открытии ИП в Армении и наличии ИП в России (патент) кому и как платить налоги? может кто-то разбирался с этим вопросом или есть что почитать по этому поводу.

К сожалению, это не так просто. Патент и УСН - специальные системы налогообложения. Часто налог в другом государстве нельзя зачесть даже при наличии межгосударственных договоров ( Письмо Департамента налоговой и таможенной политики Минфина России от 23 ноября 2016 г. N 03-11-11/69177 ) На практике я знаю, что многие просто не парятся, и платят налоги по "двум ип" в двух странах. Налоговые службы редко пускаются у глубокие расследования без оснований. Но строго по закону ситуацию нужно внимательно разбирать в деталях - время пребывания в каждой стране, детали налогового режима, место расположения источников дохода. Возможно есть какие-то особые условия в рамках ЕАЭС.