Подскажите пожалуйста, планирую на машине из РФ в Казахстан, со мной мелкая собачка, чихуа. Вроде как нужно чипировать её, а по факту, проверяет ли кто наличие чипа?

Вне зависимости от поездки надо чипировать. Это абсолютно безболезненно и никаких побочек. Но, не дай Бог, что-то произойдет - чип очень поможет найти собачку.

Вам сббж может отказать в выдаче справки без чипа.