Подскажите пожалуйста, если загранпаспорт просрочен, можно ли пересечь границу РФ по армянскому паспорту?

Если есть российское гражданство, то российскую границу не по российскому паспорту де-юре нельзя проходить.

В РФ можно вернуться даже по просроченному, страна вашего гражданства обязана принять. Вопрос возникнет как вы выехали из Армении, тогда вам придется признаться в гражданстве Армении Хотя может и из Армении можно выехать по просроченному.