Может кто-то ехал Шумилкино-Лухамаа автобусом ecolines, реально ли, что могут не пропустить до закрытия границы? И что тогда ночуют в автобусе до утра?

Из РФ в Эстонию - очень вряд ли. А вот если в РФ ехать, то вопрос есть.

Если прошли Эстонию до закрытия (а в основном так и было всё время), то РФ можно проходить сколько угодно, они работают до последнего.