Лечу из Москвы в Китай, в Шанхай транзитом через Пекин без выхода в город. Авиакомпания одна, билет один.

Багаж авиакомпания сама отправит в следующий самолет,заново оформлять не надо будет

1) паспортный контроль нужно будет проходит в городе прибытия, в вашем случае в Пекине.

2) Точную ситуацию с вашим багажом смогут рассказать только на стойке регистрации в Мск