Делаю визу в Австралию. А при переводе имени на англ в документах и сопроводительном письме нужно указывать отчество? В загранпаспорте его нет, но в др российских документах - есть. Они не сочтут это за расхождение данных?

Основной принцип перевода - точность и корректность. Если в документе есть отчество, то логично его перевести транслитерацией. Если вопрос про загранпаспорт, то нет, отчество там не переведено и переводить его не надо. В сопроводительном отчество можно не писать, да и в других документах тоже. Это необязательно

Если в загранпаспорте нет отчества (и слава Богу, вы не представляете сколько с этим проблем), то оно и не указывается.

Нет, это не будет расхождением.