Подскажите пожалуйста как переоформить казахский иин (ранее уже был иин, из-за смены загран паспорта перестал действовать) для гражданина РФ в Москве? Возможно кто-то в курсе

Через консульство только отдельным категориям граждан - инвесторам, инвалидам, несовершеннолетним детям, лицам 65+

Только через цон. Вы иин лично открывали?

ИИН действовать перестать из=за истечения срока действия паспорта не может. ИИН - он навсегда. Почти. В Вашем случае то, что не сами делали не плюс. Поэтому просто проверьте действительность ИИН, скажем через услугу оформления ЭЦП, там на входе вводится Ваше ФИО и ИИН. если система пропустит дальше, то всё с ИИН в порядке, нужно просто откорректировать его на новый паспорт.