Скажите пожалуйста вот если Гражданин России имеет жилье в Казахстане и хочет его продать гражданину Казахстана - он должен заплатить налог от продажи?

Налог уплачивается с разницы стоимостей продажи и покупки

Зависит от того - 1. каким образом оный гражданин получил оную квартиру (купил, унаследовал и т.п.) 2. как долго гражданин владел этой квартирой