Можно ли от eminönü или karaköy портов доплыть до бебека?

Насколько точное расписание - не знаю. Надо в приложении проверять. Но отвечая на ваш вопрос «можно ли» - можно.

Можно, мы тоже плыли, но надо расписание смотреть, смотря в какое время.

От еминоню в 13:35 уходит, в бебеке останавливается