Скажите пожалуйста, если ИП (юр лицо) зарегистрировано в Армении, открыли продажи вб в Армении, но еще так же решили открыть склад в России, можно ли так работать?

Вообще можно, но вот согласиться ли ваш бухгалтера… лучше посоветуйтесь со свои бухом. Так как с открытием склада в РФ и дальнейшей реализацией товара через ВБ может привести к НДС.