Подскажите пожалуйста я гражданин Казахстана, на 16 дней просрочил прибывание в РФ, какие последствия будут на границе???

Скорее всего, будет наложен штраф.

Возможен административный выдворение и последующий запрет на въезд.

Конкретные меры зависят от решения пограничных и миграционных органов, а также от наличия смягчающих обстоятельств.

Если штраф не оплатите, в самолёт не посадят. Отошлют в миграционку решить вопрос. То есть, билет на самолёт потеряете.