Хотим вместе с женой податься на визу Японии. Я и она официально трудоустроены, но все деньги находятся на ее счетах.

У нее стандартный комплект документов по списку с сайта посольства (+ копия св-ва о браке).

Для вас – было немало кейсов, когда просто прикладывали банк супруги и св-во браке и все было понятно, что это ваши общие деньги. Но в качестве подстраховки приложите ее справку из банка 2 экземпляр и спонсорское письмо от нее, ну св-во браке, чтобы показать родство. Справки с работы также ей и вам. Если у вас условно тоже есть какие-то деньги (200тр+ хотя бы), можно и вашу справку из банка довеском.