Подскажите, если у нас на двоих один алипей, мы в метро не проедем?

Купите карточки проезда, оплатите алипеем

Если именно использовать транспортный код, то в Пекин 1 человек, 1 код. Соответственно не проедете, но если платить алипей в автомате,то купите второму карточку и все.