Подскажите пожалуйста как можно законно находиться гражданину Казахстана на территории РФ больше чем 90 дней ( нет рвп)? Может по прописке?или еще как то?

Устроиться на работу. Официально.

насколько я помню - вроде можно подать на РВП или ВНЖ или гражданство - и ждать ответа - ЛЕГАЛЬНО на территории РФ, надо уточнить - можно так или нет сейчас.

вроде раньше можно было и при истечении срока (90 дней) на основании поданного заявления - миграционка вроде продляла... но конечно там реально надо подавать. собрать документы. можно платно оформить все за день...два. правда - у вас должны быть на руках все требующиеся документы (что не всегда есть - когда внезапносрочно). но как вариант почему нет.

а работа - вам особо не поможет. там же все равно надо регистрироваться в миграционке и получать хотбы РВП. или ВНЖ