Собираемся поехать в Перу, но на даты нашей возможной поездки (начало ноября) есть билеты только на маршруты 1 и 3 в Мачу-Пикчу( какие из них стоит выбрать?

Берите оба. С разницей часа 3.

Мы были на маршруте 3с (посещение нижнего уровня города + Великая Пещера) мне хотелось погулять среди руин и прикоснуться к ним, поэтому я выбирала в пользу этого.

У нас ситуация была аналогична при покупке, в наличии были только 1с и 3с, на первом маршруте только панорамные виды, Вы не сможете погулять по тропам города.

Поэтому выбирайте то, что Вам предпочтительнее.

Берите оба. Я брала 1+2, не пожалела ни секунды. 2 и 3 похожи, с 1 все наснимаете сверху, прекрасные виды. Если любите хайкинг, сходите к Воротам Солнца на 1 маршруте.