Я проживаю в Германии, имею двойное гражданство, и разные фамилии, могу ли я приехать в гости в Россию к детям , и выпустят ли меня обратно в Германию?

У вас в обоих загранпаспортах должна быть одна фамилия.

Фамилия совсем другая? Или написание немного разное в зависимости от транслитерации?

В таком случае вам нужно истребовать подтверждение гражданства России и делать новые российские паспорта

В 23 был принят закон, при котором в течение, если я не ошибаюсь 3 месяцев ваши российские документы становятся недействительными после смены имени/фамилии

Можете, муж без проблем ездил ко мне в РФ. У него тоже в русском заграннике одна фамилия и имя, а в немецких паспортах и имя и фамилия другая