Не могу разобраться, подскажите, пожалуйста.

Судя по сайту, да блокируется именно imei, а не симка. Можно просто переставить в другой телефон или слот, если две симки.

Отсчёт идёт от первой активности любой казахской симки с этим imei Вроде как, по возвращению в Россию должно снова заработать, даже с заблокированным imei.

Так как проверка идёт только на территории Казахстана

Да, но все телефоны, в которые вы будете выставлять казахстанскую симку, заблокируют по истечении 30 дней.